-“五庫一體”模式: 種質(zhì)資源保存的創(chuàng )新之舉
來(lái)源:科技日報
作者:趙漢斌
發(fā)布時(shí)間:2021-04-07
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-“五庫一體”模式: 種質(zhì)資源保存的創(chuàng )新之舉
2019年10月14日,在中國西南野生生物種質(zhì)資源庫拍攝的種子墻。本報記者 趙漢斌攝

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◎本報記者?趙漢斌

  中國西南野生生物種質(zhì)資源庫在成立之初就獨創(chuàng )了“五庫一體”的保存模式,即以植物種子庫為核心庫,兼具植物離體庫、植物DNA庫、動(dòng)物種質(zhì)庫、微生物庫,該模式成為世界生物學(xué)界的一大創(chuàng )新之舉。

  其中,植物種子庫,是中國西南野生生物種質(zhì)資源庫的核心所在,保存對象是正常性種子。通過(guò)干燥和冷凍技術(shù),對種子進(jìn)行長(cháng)期存儲,同時(shí)為資源利用和科學(xué)研究提供材料。

  植物離體庫主要保存中間性和頑拗性種子以及難以用種子保存的植物,保存的材料包括試管苗、愈傷組織、塊根、塊莖、鱗莖、球莖、珠芽、花粉、孢子及其他微繁殖體或培養物。

  植物DNA庫主要服務(wù)植物DNA庫提取、保存野生植物的總DNA用于科學(xué)研究,如篩選和鑒定具有重要價(jià)值的功能基因等,是保存珍稀瀕危物種遺傳資源的另一種手段。

  動(dòng)物種質(zhì)庫主要保存珍稀瀕危特有的野生脊椎動(dòng)物種質(zhì)資源,兼顧收集野生近緣種和特種經(jīng)濟動(dòng)物的種質(zhì)資源。

  微生物庫則長(cháng)期、安全、有效地保存具有重要經(jīng)濟價(jià)值的大型真菌種質(zhì)資源,同時(shí)加強對放線(xiàn)菌和特殊生境微生物種質(zhì)資源的收集。

  為保證庫內寶貴野生植物種子資源的安全,該種質(zhì)資源庫采取了一系列嚴密的安保措施。在電力供應方面,種子保存設施采用雙回路供電。主電路斷電后,自動(dòng)切換另一條電路供電;如果兩條電路都斷電,備用的大功率柴油發(fā)電機將在45秒內啟動(dòng),繼續供電。種子干燥和冷藏都有兩套空氣干燥制冷壓縮系統循環(huán)使用,可確保設施穩定。

  在該種質(zhì)資源庫,種子保藏是基礎,研究應用是靈魂。2017年,依托該種質(zhì)資源庫建設的“國家重要野生植物種質(zhì)資源共享服務(wù)平臺”正式被科技部、財政部列入我國首批28個(gè)國家科技資源共享服務(wù)平臺之一。2019年,“國家重要野生植物種質(zhì)資源共享服務(wù)平臺”更名為“國家重要野生植物種質(zhì)資源庫”,成為我國30個(gè)國家生物種質(zhì)與實(shí)驗材料資源庫之一。

  近年來(lái),該種質(zhì)資源庫結合新一代測序技術(shù)的發(fā)展,針對核心DNA條形碼在一些類(lèi)群中鑒定率不高的問(wèn)題,提出了DNA條形碼2.0的概念;通過(guò)二代測序技術(shù)體系的建立和完善,解決了高度降解樣本的建庫測序技術(shù)難題;并開(kāi)創(chuàng )性地提出利用保守引物進(jìn)行DNA長(cháng)片段擴增富集,獲得被子植物完整的葉綠體基因組;完成稻屬AA-基因組普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、長(cháng)雄蕊野生稻、展穎野生稻和南方野生稻7個(gè)物種的基因組計劃,在國際上首次構建了多達8個(gè)水稻及其近緣物種的比較與進(jìn)化基因組學(xué)研究框架,為我國和世界水稻科學(xué)家高效地發(fā)掘與利用野生稻種質(zhì)資源奠定了堅實(shí)的科學(xué)基礎。

  該種質(zhì)資源庫研究團隊還開(kāi)發(fā)了質(zhì)體基因組精準組裝工具GetOrganelle;揭示了溫帶竹類(lèi)復雜的輻射演化和網(wǎng)狀進(jìn)化歷史;解析了豆科植物深度系統發(fā)育關(guān)系,揭示了植物質(zhì)體基因組可能的雙親遺傳進(jìn)化模式;以橡膠為研究對象,揭示了大戟植物染色體進(jìn)化、膠乳生物合成途徑。

  此外,該種質(zhì)資源庫還通過(guò)其官網(wǎng),實(shí)現了植物學(xué)基礎信息、資源保藏信息以及保藏現狀等信息數據和種質(zhì)資源實(shí)物共享。近年來(lái),種質(zhì)庫累計服務(wù)用戶(hù)單位321個(gè),服務(wù)用戶(hù)2437人次,向124家機構分發(fā)共享13179份、共522475粒植物種子。


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