鞭毛馬達結構(左)及其工作機制示意圖
自17世紀列文虎克第一次觀(guān)察到能夠移動(dòng)的細菌后,細菌運動(dòng)能力及其機制引起了科學(xué)家的強烈興趣。細菌是怎么跑得這么快的?它是什么樣的跑法?一連串的疑問(wèn)盤(pán)繞在科學(xué)家的腦海里,很多科學(xué)家加入這一研究領(lǐng)域,然而很多疑問(wèn)依然有待解開(kāi)。
4月20日,《細胞》雜志刊登浙江大學(xué)生命科學(xué)研究院教授朱永群團隊與醫學(xué)院教授張興團隊合作研究成果,揭示了沙門(mén)氏菌鞭毛馬達的原子分辨率結構。這是一個(gè)6.3兆達爾頓(MDa)的超大復合物,包含了12種不同的蛋白質(zhì),總共有175個(gè)亞基。通過(guò)對鞭毛馬達扭矩傳輸機制的剖析,解開(kāi)了困惑學(xué)界幾十年的細菌鞭毛馬達工作原理難題,揭開(kāi)了細菌跑得快的秘密,為抗生素設計提供了新思路。
朱永群表示,這項工作是細菌領(lǐng)域的一個(gè)重要突破,之前很多關(guān)于鞭毛馬達的推論現在被證明是不對的。自然界還有一種分子馬達叫“ATP合成酶”,研究證明鞭毛馬達的扭矩傳輸機制完全不同于A(yíng)TP合成酶,說(shuō)明自然界分子馬達工作原理的多樣性,為更好地了解微觀(guān)世界的分子發(fā)動(dòng)機奠定了基礎。
張興說(shuō),細菌鞭毛是一個(gè)精巧復雜的機器,是自然界分子進(jìn)化的杰作。這項研究通過(guò)對鞭毛馬達的結構解析,不僅從原子水平揭示了其工作原理,為納米機器的研究帶來(lái)積極的啟發(fā)意義,也為研究這個(gè)復雜納米機器的起源進(jìn)化提供了可靠的結構信息,為生物進(jìn)化理論帶來(lái)新的視角。
細菌與人類(lèi)等其他生物具有漫長(cháng)的生物共進(jìn)化過(guò)程,為了避免被人類(lèi)免疫系統追殺,或者為了成功找到適宜的生存和感染的位置,細菌進(jìn)化出了快速“游動(dòng)”的能力。
細菌這一快速游動(dòng)的能力是基于一個(gè)特殊的運動(dòng)器官——鞭毛。鞭毛馬達旋轉并產(chǎn)生動(dòng)力,通過(guò)扭矩傳輸給接頭裝置,然后傳給鞭毛絲,從而帶動(dòng)鞭毛絲的轉動(dòng)。
鞭毛馬達是自然界中最復雜的蛋白質(zhì)機器之一,它能夠每秒鐘旋轉300-2400圈。世界上70%的細菌都具有鞭毛,之前微生物遺傳學(xué)家和生物化學(xué)家對鞭毛馬達進(jìn)行了大量的研究,對鞭毛馬達進(jìn)行了很多描述,然而其工作原理依然很不清楚。
“為了解決這一世界難題,我們希望解析它的高分辨結構。我們碰到的第一個(gè)難點(diǎn)就是如何完整地提取鞭毛馬達,它太大了?!敝煊廊赫f(shuō)。團隊經(jīng)過(guò)大量的嘗試,通過(guò)遺傳改造的方法,改變了傳統極易破壞結構的酸堿處理法,設計出溫和的純化步驟,最終獲得了來(lái)源于沙門(mén)氏菌的完整的鞭毛馬達與接頭裝置的復合物樣品,并與浙江大學(xué)冷凍電鏡中心主任張興教授合作,利用300千伏冷凍電鏡平臺,收集了冷凍電鏡數據,首次解析了原子分辨率的鞭毛馬達結構。
細菌為什么能跑得那么快?浙大科研人員解析的這個(gè)鞭毛馬達結構清晰地揭示了其中的奧秘。鞭毛馬達含有質(zhì)子泵,通過(guò)轉運氫離子,帶動(dòng)質(zhì)子泵的轉動(dòng),將化學(xué)能轉變?yōu)闄C械能,繼而將扭矩傳給鞭毛馬達的內膜環(huán),促使內膜環(huán)的轉動(dòng)。
內膜環(huán)結構非常特殊,它不僅可以旋轉和傳輸扭矩,而且是整個(gè)鞭毛馬達的組裝底座。
正因為結構的獨特性以及各個(gè)結構元件之間相互精妙的配合,鞭毛馬達能將質(zhì)子泵轉化而來(lái)的機械能,毫無(wú)損耗地迅速傳給鞭毛絲,促進(jìn)鞭毛絲高速轉動(dòng)。細菌有了如此非凡的“風(fēng)火輪”裝備,進(jìn)而得以快速運動(dòng)。
細菌鞭毛是微生物學(xué)課本的基本內容,這項工作終于向人們揭開(kāi)了其神秘面紗,鞭毛馬達工作機制的揭示更具有教科書(shū)級別的科學(xué)意義。
一位評審專(zhuān)家說(shuō),這是一個(gè)里程牌的結構研究工作。另一位評審專(zhuān)家表示,這是一件杰出的研究工作,它揭示了細菌鞭毛未知部分的無(wú)與倫比的高分辨率精細結構和鞭毛馬達工作原理。
相關(guān)論文信息:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00430-X
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