據中國農業(yè)科學(xué)院最新消息,該院北京畜牧獸醫研究所動(dòng)物基因工程與種質(zhì)創(chuàng )新團隊聯(lián)合北京相關(guān)生物企業(yè)等,成功繪制了梅山豬高質(zhì)量基因組圖譜。這是迄今為止精度最高的亞洲豬基因組圖譜,為我國地方豬種質(zhì)資源保護和開(kāi)發(fā)利用奠定了基礎。相關(guān)成果發(fā)表于《分子生態(tài)資源》雜志。
項目負責人、中國農科院北京牧醫所周榮博士介紹,我國地方豬種具有肉質(zhì)好、抗逆性強、耐粗飼等特點(diǎn),是生豬種業(yè)持續創(chuàng )新和實(shí)現種源自主可控的良好素材。國內外學(xué)者針對我國地方豬種的抗病力、繁殖性能等重要經(jīng)濟性狀的遺傳機制開(kāi)展了大量研究,產(chǎn)生了海量重測序、轉錄組數據。分析研究這些數據需要與參考基因組進(jìn)行比對,但目前豬功能基因組學(xué)研究大多利用西方豬種杜洛克的基因組序列,這在一定程度上限制了對亞洲家豬的基因組學(xué)研究。
團隊成功繪制了我國地方品種梅山豬的高質(zhì)量基因組圖譜,基因組大小為2.51Gb,共注釋到22074個(gè)編碼基因,是目前完整度最高、連續性最強的亞洲豬基因組圖譜。研究人員對梅山豬和杜洛克豬的基因組進(jìn)行了比較分析,發(fā)現梅山豬基因組共存在49103個(gè)結構變異,其中4.02%是亞洲豬特有的結構變異。研究還發(fā)現亞洲豬X染色體上存在一個(gè)30Mb的特有結構變異熱點(diǎn),該熱點(diǎn)富集了與亞洲豬脂肪沉積、高繁殖力等特異性表型相關(guān)的基因。
該項研究得到國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目、國家重點(diǎn)研發(fā)計劃等項目的支持。
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